NRGene只用不到7周就完成了最广泛使用的服装棉——陆地棉的基因组组装

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  2017年8月8日,以色列耐斯茨奥纳 —基因组组装和分析的全球领导者NRGene与中国领先的基因组学技术企业 — 基诺信息科技(深圳)有限公司(简称“基诺科技”),携手提供两个完整的棉花基因组。

  “我们第一次对陆地棉(Gossypium hirsutum)进行测序是在2015年,”浙江大学的张天真教授说,“除了陆地棉,现在我们希望借助更先进的技术,能获得更为完整的海岛棉(Gossypium barbadense)基因组版本。因此,我们联手NRGene组装更多完整的棉花基因组。”

  陆地棉占全球棉花产量的90%,被用来生产世界上大部分的服装。海岛棉,又称为超长绒棉(ELS),主要用于高档棉织物。

  “我们一直与张教授保持非常紧密的合作,以促进整个项目的进程,”基诺科技的董事总经理Flora Liew说,“我们对DeNovoMAGIC的组装速度以及高质量结果感到震撼。”

  完成了全面的基因组组装之后,对于分析该物种的其他数千个品种将会变得更加迅速和低廉,因为该物种的基因组架构已经完整了。

  NRGene的DeNovoMAGIC 3.0提供基于原始测序数据的基因组组装。PanMAGIC则用于泛基因组组装。它对所有的基因组进行组装和相互比对,不仅可以从最佳的角度来研究局部基因组区域的各种变异,例如SNP,还可以全方位研究所有染色体区域的易位,重复,PAV,CNV,SV等变异。

  “棉花是世界上最重要的非粮食作物,”NRGene首席执行官Gil Ronan博士说,“通过传递我们对棉花构成的独到见解,我们正在帮助研究人员开发更健康,更高产,而投入资源却更少的植物。”

  关于NRGene

  NRGene(www.nrgene.com)是一家基因大数据公司,开发最先进的软件和算法以揭示动植物的复杂性和多样性,用于各种作物,动物,水生生物,助力于最先进和复杂的育种项目。NRGene的工具已经被世界领先的种子企业和学术界最有影响力的研究团队认可和采用。

  关于基诺科技

  基诺信息科技(深圳)有限公司致力于基因大数据的研究,自主研发了分析功能全面的基因大数据可视化分析系统(Genosys Mendel Analytics)。基诺科技作为NRGene的中国官方代理商,在基因大数据算法和分析研发方面合作紧密,成功为多家国内著名科研院所提供专业的基因组组装,基因注释,进化分析和比较分析等服务。

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